Neben Objekten aus dem städtischen Alltagsleben, der Hansezeit und der Soester Fehde werden im Burghofmuseum auf 700 m² sowie auf dem Freigelände zahlreiche Gegenstände und Dokumente der bedeutenden sakralen Kunst und der Soester Kirchengeschichte präsentiert. Darüber hinaus befindet sich im Burghofmuseum eine nahezu komplette Sammlung von etwa 300 Kupferstichen von Heinrich Aldegrever, einem bedeutenden Maler, Kupferstecher und Siegelschneider der Renaissance.